우리가 원하는 절대적 다수의 미생물을 발효시키고자 하는 기질 또는 식품에 접종시켜 성장하도록 하므로 원하는 발효가 일어나도록 해준다.

원하지 않는 미생물의 오염과 성장의 기회를 극소화한다.

균일한 성능의 발효미생물을 사용함으로써 자연발효법에 의하여 제조되는 제품보다 품질이 균일하고, 우수한 제품을 많이 생산할 수 있다.

발효미생물의 성장속도를 조정할 수 없어서 공장에서 제조계획에 맞출 수 없다.