파일을 암호화하기 위해서는 지정된 파일에 대한 ′파일 속성′ 중 ′고급′을 선택하여 ′데이터 보호를 위한 내용을 암호화′ 선택한다.

파일 암호화 키가 없는 경우 암호화된 파일의 이름을 변경할 수 없고 내용도 볼 수 없지만 파일 복사는 가능하다.

백업된 파일 암호화 키가 있는 경우 인증서 관리자(certmgr.msc)를 통해 인증서 키를 ′가져오기′하여 암호화된 파일을 열수 있다.

파일 암호화 키 백업을 하여 암호화된 파일에 영구적으로 액세스하지 못하게 되는 것을 방지할 수 있다. 암호화 키 백업은 주로 다른 컴퓨터나 USB 메모리 등의 별도로 저장할 것을 권장한다.